En este trabajo se ha analizado la evolución del número efectivo de la población base o fundadora de la estirpe Cartujana del caballo de P.R.E. El Libro Genealógico de la raza ha suministrado la información necesaria para constituir la base de datos formada por los 2.673 caballos Cartujanos inscritos hasta el año 1991. En cuanto a la población base o fundadora de la estirpe Cartujana, está constituida por aquellos antecesores que cierran los pedigríes de los animales que forman la estirpe. Según nuestros resultados es de 220 el número de animales que integra el grupo fundacional. En la actualidad y debido a la política de utilización exhaustiva de los individuos más emblemáticos y al tipo de endocría en línea empleada dentro de una estirpe con un bajo número efectivo de reproductores, sólo existe representación genética efectiva de 22 antecesores (11 sementales y 11 yeguas). El Índice de Conservación Genético medio parece haber llegado a una fase de estabilización después de un paulatino incremento a lo largo de los sucesivos periodos generacionales, siendo en el último intervalo analizado (1980-1990) de 14,23.