A técnica espectrométrica de FTIR vem sendo amplamente utilizada como método diagnóstico devido a sua rapidez, sensibilidade e capacidade de analisar os biomateriais de modo não destrutivo. Este trabalho visa analisar a possibilidade de utilização desta técnica no estudo da agregação molecular das fibras de colágeno, bem como determinar a existência de algum indicador deste fenômeno, uma vez que a agregação desta fibras está relacionada a uma série de fenômenos fisiológicos como ossificação, inflamação e envelhecimento. Foram analisadas quatro tipos de amostras: tendão sem tratamento, tendão tratado com condroitin sulfato, tendão tratado com papaína e gelatina. Foi observado um aumento da intensidade da banda amida I (estiramento do grupo C=O) no espectro do tendão tratado com condroitin sulfato e uma diminuição da mesma nos espectros da gelatina e do tendão tratado com papaína em relação ao espectro sem tratamento. Estes resultados sugerem uma relação inversa entre a intensidade da banda amida I e o grau de agregação molecular das fibras de colágeno. Portanto, pode se afirmar que a técnica de FTIR é capaz de detectar alterações no estado de agregação molecular das fibras de colágeno e que a banda de amida I é o indicador deste fenômeno