El presente trabajo de investigación titulado: “ ENFOQUE INTEGRAL DE AUDITORIA DE GESTIÓN PRESUPUESTARIA AL SECTOR PUBLICO: REGIÓN PUNO” se ha realizado en la región Puno comprendiendo las unidades ejecutoras de presupuestos: Sede Puno, Educación, Salud, Agricultura, Transportes y Proyecto Carretera Transoceánica, con la finalidad de dar respuesta a los interrogantes: ¿ Cómo es la Gestión Presupuestaria en el Región Puno? y ¿Por qué las Oficinas de Auditoría Interna de la región no practican la Auditoría de Gestión Presupuestaria? y efectuar un análisis crítico a la gestión del presupuesto desde la perspectiva de planificación, organización, gobierno y control. La metodología empleada para este fin incluyó: visitas, entrevistas a los funcionarios de la Región Puno, Dirección Nacional de Presupuesto, Ministerio de la Presidencia y Contraloría General de República; recopilación de información y bibliografía, así como la observación directa; y análisis de los procesos, operaciones y documentos obtenidos de las referidas entidades. Los resultados en el presente trabajo de investigación demuestran que los factores que incidieron en la ineficiencia de la gestión presupuestaria regional fueron: la inadecuada planificación, organización vertical, gobierno y control débil o baja; ausencia de auditorías a la gestión de los presupuestos asignados y el centralismo. La planeación es importante para fijar los grandes objetivos en la gestión regional, ello implica tener como soporte los planes estratégicos de desarrollo a corto, mediano y largo plazo; los presupuestos deben ser coherentes a dichos planes. La organización de tipo vertical limita la comunicación interna y con su entorno externo, las decisiones son lentas y burocráticas, por tales razones es necesario la horizontalización de la organización y elaborar un “Presupuesto Integral” multianual que comprenda presupuestos parciales por áreas, actividades e inversión, que permitan identificar los gasto y costos en la gestión, medir el impacto y desempeño; mejoras en el control y la toma de decisiones. La dirección o gobierno de los presupuestos es débil, debido a los cambios continuos del presidente ejecutivo, a la falta de liderazgo, delegación del poder (empowerment), gestión en equipo y ausencia de una filosofía organizacional y de procesos o trabajos del personal. El proceso de gestión presupuestaria de actividades y proyectos de inversión del sector público comprende: la planeación, programación, formulación, aprobación, ejecución, control y evaluación del presupuesto. En las cuales existe una excesiva concentración del poder de decisión presupuestal en el Vice Ministerio de Hacienda del MEF, con excepción en las fases de planeación, control, evaluación y parcialmente en la ejecución del proceso presupuestario; y en cuanto a la distribución de los recursos públicos no hay equidad, concentrándose en el orden de 60 al 74.5% los recursos en la capital de la República y gobierno central. El monitoreo y control de la gestión presupuestaria han sido débiles en la década del 90 ante esta situación se propone la “Auditoría de Gestión Presupuestaria” para el Sector Público, como una modalidad nueva de la auditoría para examinar, evaluar y monitorear los distintos procesos del presupuesto y el grado de economía, eficiencia y eficacia en la gestión de los mismos; así como el desempeño de los gestores del Estado, respecto al cumplimiento de las metas programadas y el grado con que se están logrando los resultados y beneficios previstos por la legislación presupuestal y planes de desarrollo de la entidad. La Auditoria de Gestión Presupuestaria tiene carácter preventivo y correctivo, además de ser una herramienta de rendición de cuenta sobre la gestión de los recursos públicos, a diferencia de los demás tipos de auditoría se debe aplicar en tres momentos: a) La auditoria ex antes o a priori de la aprobación del presupuesto. Examina la racionalidad de la asignación de presupuestos a las actividades o proyectos de inversión y si estos son adecuados y suficientes para lograr los objetivos y metas planeadas. b) La auditoria concurrente a la ejecución del presupuesto. Examina paralelo a la ejecución de flujos de presupuesto y realización de las metas de los proyectos y actividades a fin de detectar las desviaciones y recomendar su corrección. c) Auditoría posterior a la ejecución del presupuesto. Examina la ejecución anual de los presupuestos para la Cuenta General de la República; con el objeto de expresar una expresar una opinión sobre la razonabilidad con que se presentan el Estado de Ejecución Presupuestario de Ingresos y Gastos, Programación y Ejecución de Ingresos y del Gasto, Estado de Fuentes y Usos de fondos, Clasificación Funcional y Clasificación Geográfica del Gasto, de conformidad con los Principios de Contabilidad Generalmente Aceptados y Normas Legales Presupuestarias.