Devido a estrutura multiclonal do Trypanosoma cruzi (Chagas, 1909), e sua extrema variabilidade genética, diversos estudos de caracterização enzimática (zimodemas) e molecular de diferentes subpopulações deste parasita foram realizados, definindo-se então duas principais linhagens distintas e distantes filogenéticamente: T. cruzi (TcI e TcII). O primeiro aspecto abordado neste trabalho, tratou-se de diferenciar as principais subpopulações do T. cruzi in vitro, utilizando lectinas como marcadores bioquímicos. Posteriormente, para compreendermos o comportamento entre as duas linhagens de T. cruzi, foram avaliadas a cinética de co-cultivo envolvendo TcI e TcII em meio axênico e no trato digestivo de Triatomabrasiliensis (Neiva, 1911). A segunda parte do presente trabalho está relacionada ao estudo dos mecanismos de defesa deste vetor, uma vez que os insetossintetizam inúmeros peptídeos antimicrobianos em resposta a uma infecção por bactérias ou por qualquer outro agente patógeno. Sabe-se que estes peptídeosfazem parte da immunidade inata dos insetos e possuem propriedades de lisar bactérias Gram-positivas e Gram-negativas. Para isso, genes que codificamlisozimas e defensinas do trato digestivo de T. brasiliensis, foram isolados, caracterizados e sequenciados. As defensinas são encontradas em diversas espécies de insetos, mamíferos e plantas, e pertencem ao grupo de peptídeos ricos em cisteínas, sendo extremamente ativas contra bactérias Gram-positiva. As lisozimas também são encontradas em insetos de diferentes ordens e em alguns gêneros como Drosophila e Musca, podem atuar como enzimas digestivas. Além do isolamento e caracterização destes peptídeos, também avaliamos os padrões de expressão dos mesmos, em diferentes segmentos do trato digestivo do insetovetor, através das técnicas de hibridização in situ e PCR tempo-real.