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Estudo da diversidade de Potato virus Y (PVY) em batata (Solanum tuberosum), no Brasil.
Leonardo Nunes Fonseca
Location: http://www.bdtd.ucb.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=184

A virose causada por Potato virus Y é um dos maiores problemas da bataticultura brasileira. Este problema agravou-se com entrada de uma nova variante da estirpe necrótica PVYN, denominada PVYNTN, a qual tem causado perdas nas lavouras pela ocorrência de necrose na superfície do tubérculo, impossibilitando assim a comercialização. Devido a este problema e com o intuito de conhecer a real diversidade do PVY no Brasil, este trabalho teve como objetivos detectar a variante PVYNTN, PVYO e PVYN, bem como realizar um estudo filogenético de isolados de PVY coletados em diferentes regiões do Brasil, enfocando as regiões da P1 e capa protéica. Foram realizados testes com plantas indicadoras de sintomas, testes sorológicos do tipo DAS-ELISA e em nível de ácidos nucléicos RT-PCR em 31 isolados de PVY, oriundos de quatro estados brasileiros, Minas Gerais (MG), São Paulo (SP), Santa Catarina (SC) e Rio Grande do Sul (RS). O teste sorológico detectou a presença de PVY em todas as amostras. Para otimização do sistema, foi fundamental a escolha do método de extração de RNA total, dentre os quais foram testados três metodologias: TRIZOL (GIBCO), o método de hidrocloreto de guanidina e o método proposto por Singh (1998). O melhor método foi escolhido baseado na qualidade da amplificação produzida bem como no custo do método. Os resultados mostraram alta eficiência do sistema de extração de RNA utilizando o método de hidrocloreto de guanidina. O método molecular adaptado RT- PCR, foi realizado utilizando a combinação de 5 oligonucleotídeos para diferenciação das estirpes de PVY. Os resultados mostraram a detecção de um isolado de PVYO em SC, três no RS; um isolado de PVYN em SC, quatro no RS. Já os PVYNYN, foram detectados em MG (seis isolados), SC (três isolados) e SP (10 isolados). Os resultados do sistema ?3-Primer RT-PCR? foram coerentes com os sintomas induzidos por plantas indicadoras e os sintomas em tubérculos foram diagnosticados como PVYNTN. O sequenciamento foi realizado enfocando a região da proteína P1 e da capa protéica. Foram sequenciados oito isolados de PVY para a P1 e 12 isolados para a capa protéica. Os resultados mostraram para a proteína P1, a formação de dois agrupamentos de PVYN e PVYNTN oriundos da Europa e América do Norte, e um outro grupo reunindo a estirpe PVYO e demais PVY necróticos. Os isolados necróticos coletados no Brasil foram agrupados no conjunto Europeu. Para a região da capa protéica dos PVY não houve um agrupamento que unisse mesmas estirpes/variante.

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Detalles del recurso

Estudo da diversidade de Potato virus Y (PVY) em batata (Solanum tuberosum), no Brasil.
Id. 3275357
Idioma PT
Titulo Estudo da diversidade de Potato virus Y (PVY) em batata (Solanum tuberosum), no Brasil.
Autor(es) Leonardo Nunes Fonseca
Location http://www.bdtd.ucb.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=184
Versión 1.0
Estado Final
Descripción A virose causada por Potato virus Y é um dos maiores problemas da bataticultura brasileira. Este problema agravou-se com entrada de uma nova variante da estirpe necrótica PVYN, denominada PVYNTN, a qual tem causado perdas nas lavouras pela ocorrência de necrose na superfície do tubérculo, impossibilitando assim a comercialização. Devido a este problema e com o intuito de conhecer a real diversidade do PVY no Brasil, este trabalho teve como objetivos detectar a variante PVYNTN, PVYO e PVYN, bem como realizar um estudo filogenético de isolados de PVY coletados em diferentes regiões do Brasil, enfocando as regiões da P1 e capa protéica. Foram realizados testes com plantas indicadoras de sintomas, testes sorológicos do tipo DAS-ELISA e em nível de ácidos nucléicos RT-PCR em 31 isolados de PVY, oriundos de quatro estados brasileiros, Minas Gerais (MG), São Paulo (SP), Santa Catarina (SC) e Rio Grande do Sul (RS). O teste sorológico detectou a presença de PVY em todas as amostras. Para otimização do sistema, foi fundamental a escolha do método de extração de RNA total, dentre os quais foram testados três metodologias: TRIZOL (GIBCO), o método de hidrocloreto de guanidina e o método proposto por Singh (1998). O melhor método foi escolhido baseado na qualidade da amplificação produzida bem como no custo do método. Os resultados mostraram alta eficiência do sistema de extração de RNA utilizando o método de hidrocloreto de guanidina. O método molecular adaptado RT- PCR, foi realizado utilizando a combinação de 5 oligonucleotídeos para diferenciação das estirpes de PVY. Os resultados mostraram a detecção de um isolado de PVYO em SC, três no RS; um isolado de PVYN em SC, quatro no RS. Já os PVYNYN, foram detectados em MG (seis isolados), SC (três isolados) e SP (10 isolados). Os resultados do sistema ?3-Primer RT-PCR? foram coerentes com os sintomas induzidos por plantas indicadoras e os sintomas em tubérculos foram diagnosticados como PVYNTN. O sequenciamento foi realizado enfocando a região da proteína P1 e da capa protéica. Foram sequenciados oito isolados de PVY para a P1 e 12 isolados para a capa protéica. Os resultados mostraram para a proteína P1, a formação de dois agrupamentos de PVYN e PVYNTN oriundos da Europa e América do Norte, e um outro grupo reunindo a estirpe PVYO e demais PVY necróticos. Os isolados necróticos coletados no Brasil foram agrupados no conjunto Europeu. Para a região da capa protéica dos PVY não houve um agrupamento que unisse mesmas estirpes/variante.
Tipo PDF
Palabras clave VIROLOGIA
Tipo de recurso Electronic Thesis or Dissertation
Tese ou Dissertacao Eletronica
Tipo de Interactividad Expositivo
Nivel de Interactividad muy bajo
Audiencia Estudiante
Profesor
Autor
Estructura Atomic
Coste no
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Fecha de contribución 28-may-2008
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