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Estudo da diversidade de Potato virus Y (PVY) em batata (Solanum tuberosum), no Brasil.
Leonardo Nunes Fonseca
Location:
http://www.bdtd.ucb.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=184
A virose causada por Potato virus Y é um dos maiores problemas da bataticultura brasileira. Este problema agravou-se com entrada de uma nova variante da estirpe necrótica PVYN, denominada PVYNTN, a qual tem causado perdas nas lavouras pela ocorrência de necrose na superfície do tubérculo, impossibilitando assim a comercialização. Devido a este problema e com o intuito de conhecer a real diversidade do PVY no Brasil, este trabalho teve como objetivos detectar a variante PVYNTN, PVYO e PVYN, bem como realizar um estudo filogenético de isolados de PVY coletados em diferentes regiões do Brasil, enfocando as regiões da P1 e capa protéica. Foram realizados testes com plantas indicadoras de sintomas, testes sorológicos do tipo DAS-ELISA e em nível de ácidos nucléicos RT-PCR em 31 isolados de PVY, oriundos de quatro estados brasileiros, Minas Gerais (MG), São Paulo (SP), Santa Catarina (SC) e Rio Grande do Sul (RS). O teste sorológico detectou a presença de PVY em todas as amostras. Para otimização do sistema, foi fundamental a escolha do método de extração de RNA total, dentre os quais foram testados três metodologias: TRIZOL (GIBCO), o método de hidrocloreto de guanidina e o método proposto por Singh (1998). O melhor método foi escolhido baseado na qualidade da amplificação produzida bem como no custo do método. Os resultados mostraram alta eficiência do sistema de extração de RNA utilizando o método de hidrocloreto de guanidina. O método molecular adaptado RT- PCR, foi realizado utilizando a combinação de 5 oligonucleotídeos para diferenciação das estirpes de PVY. Os resultados mostraram a detecção de um isolado de PVYO em SC, três no RS; um isolado de PVYN em SC, quatro no RS. Já os PVYNYN, foram detectados em MG (seis isolados), SC (três isolados) e SP (10 isolados). Os resultados do sistema ?3-Primer RT-PCR? foram coerentes com os sintomas induzidos por plantas indicadoras e os sintomas em tubérculos foram diagnosticados como PVYNTN. O sequenciamento foi realizado enfocando a região da proteína P1 e da capa protéica. Foram sequenciados oito isolados de PVY para a P1 e 12 isolados para a capa protéica. Os resultados mostraram para a proteína P1, a formação de dois agrupamentos de PVYN e PVYNTN oriundos da Europa e América do Norte, e um outro grupo reunindo a estirpe PVYO e demais PVY necróticos. Os isolados necróticos coletados no Brasil foram agrupados no conjunto Europeu. Para a região da capa protéica dos PVY não houve um agrupamento que unisse mesmas estirpes/variante.
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Detalles del recurso
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Estudo da diversidade de Potato virus Y (PVY) em batata (Solanum tuberosum), no Brasil.
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| Id. |
3275357 |
| Idioma |
PT
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| Titulo |
Estudo da diversidade de Potato virus Y (PVY) em batata (Solanum tuberosum), no Brasil. |
| Autor(es) |
Leonardo Nunes Fonseca |
| Location |
http://www.bdtd.ucb.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=184
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| Versión |
1.0 |
| Estado |
Final
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| Descripción |
A virose causada por Potato virus Y é um dos maiores problemas da bataticultura brasileira. Este problema agravou-se com entrada de uma nova variante da estirpe necrótica PVYN, denominada PVYNTN, a qual tem causado perdas nas lavouras pela ocorrência de necrose na superfície do tubérculo, impossibilitando assim a comercialização. Devido a este problema e com o intuito de conhecer a real diversidade do PVY no Brasil, este trabalho teve como objetivos detectar a variante PVYNTN, PVYO e PVYN, bem como realizar um estudo filogenético de isolados de PVY coletados em diferentes regiões do Brasil, enfocando as regiões da P1 e capa protéica. Foram realizados testes com plantas indicadoras de sintomas, testes sorológicos do tipo DAS-ELISA e em nível de ácidos nucléicos RT-PCR em 31 isolados de PVY, oriundos de quatro estados brasileiros, Minas Gerais (MG), São Paulo (SP), Santa Catarina (SC) e Rio Grande do Sul (RS). O teste sorológico detectou a presença de PVY em todas as amostras. Para otimização do sistema, foi fundamental a escolha do método de extração de RNA total, dentre os quais foram testados três metodologias: TRIZOL (GIBCO), o método de hidrocloreto de guanidina e o método proposto por Singh (1998). O melhor método foi escolhido baseado na qualidade da amplificação produzida bem como no custo do método. Os resultados mostraram alta eficiência do sistema de extração de RNA utilizando o método de hidrocloreto de guanidina. O método molecular adaptado RT- PCR, foi realizado utilizando a combinação de 5 oligonucleotídeos para diferenciação das estirpes de PVY. Os resultados mostraram a detecção de um isolado de PVYO em SC, três no RS; um isolado de PVYN em SC, quatro no RS. Já os PVYNYN, foram detectados em MG (seis isolados), SC (três isolados) e SP (10 isolados). Os resultados do sistema ?3-Primer RT-PCR? foram coerentes com os sintomas induzidos por plantas indicadoras e os sintomas em tubérculos foram diagnosticados como PVYNTN. O sequenciamento foi realizado enfocando a região da proteína P1 e da capa protéica. Foram sequenciados oito isolados de PVY para a P1 e 12 isolados para a capa protéica. Os resultados mostraram para a proteína P1, a formação de dois agrupamentos de PVYN e PVYNTN oriundos da Europa e América do Norte, e um outro grupo reunindo a estirpe PVYO e demais PVY necróticos. Os isolados necróticos coletados no Brasil foram agrupados no conjunto Europeu. Para a região da capa protéica dos PVY não houve um agrupamento que unisse mesmas estirpes/variante. |
| Tipo |
PDF |
| Palabras clave |
VIROLOGIA |
| Tipo de recurso |
Electronic Thesis or Dissertation
Tese ou Dissertacao Eletronica
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| Tipo de Interactividad |
Expositivo
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| Nivel de Interactividad |
muy bajo
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| Audiencia |
Estudiante
Profesor
Autor
|
| Estructura |
Atomic |
| Coste |
no
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| Copyright |
sí
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Liberar o conteúdo dos arquivos para acesso público |
| Formatos |
PDF |
| Requerimientos técnicos |
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| Fecha de contribución |
28-may-2008 |
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