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Estratégias para prospecção e predição de peptídeos bioativos
Guilherme Dotto Brand
Location:
http://bdtd.bce.unb.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=3082
Os capítulos um e dois tratam da prospecção de peptídeos bioativos da secreçãode Phyllomedusa hypochondrialis. Mais especificamente, o primeiro aplica técnicasproteômicas, principalmente espectrometria de massa, para o estudo de peptídeosrelacionados à bradicinina (BRPs). Estes estavam presentes tanto na secreção solúvelquanto em fragmentos dissecados de pele do anfíbio. Dezoito BRPs, assim como suasmodificações pós-traducionais, foram caracterizados por seqüenciamento MS/MS denovoe experimentos de geração de imagens por MALDI em um fragmento de pele. Essasmoléculas tiveram alta similaridade de seqüência com as cininas plasmáticas de algunsmamíferos e répteis. Tamanha diversidade de moléculas dentro da mesma famíliapeptídica e pertencendo a mesma espécie pode estar relacionada à especializaçõesfuncionais desses peptídeos a uma variedade de receptores correspondentes em diferentespredadores. Também um novo análogo, [Val]1,[Thr]6-bradicinil-Gln,Ser teve suaatividade biológica detectada em culturas celulares expressando o receptor de bradicininahumana B2 e em preparações de íleo de porquinho-da-índia.O capítulo dois descreve a mesma aproximação metodológica para o estudo depeptídeos antimicrobianos da família das dermaseptinas. As estruturas primárias dessasmoléculas, nomeadas de DShypo 01, 02, 03, 04, 06 e 07 foram obtidas por experimentosMS/MS de novo, degradação de Edman e seqüenciamento de cDNA. O quinto peptídeofoi o mesmo DS 01 de Phyllomedusa oreades, previamente descrito pelo nosso grupo. Amaioria dos peptídeos purificados do extrato cutâneo total de P. hypochondrialis pôde serdiretamente localizada e mapeada em um fragmento de pele dorsal usando técnicas deobtenção de imagens por espectrometria de massa. Comparações foram feitas entrepeptídeos e drogas comerciais com relação à suas atividades antimicrobianas e contraLeishmania amazonensis. Também foram executados estudos comparativos dos efeitoslíticos em células do sangue de mamíferos e da interação com vesículas de DMPC porressonância plasmônica de superfície.Os capítulos três e quatro tratam do estudo da interação de peptídeos membranoativoscom membranas modelo, com ênfase em sua categorização em grupos e prediçãode atividade. Para tal, dezessete peptídeos membrano-ativos foram sintetizados e tiveram suas interações com vesículas unilamelares de DMPC e de DMPC/DMPG (2:1 mol/mol)estudadas por uma série de técnicas biofísicas. Estas técnicas permitiram a dissecção dasinterações entre peptídeos e membranas em termos de sua interação inicial, grau deinserção em membranas e indução de extravasamento de marcadores fluorescentes. Poresta aproximação, ficou clara a existência de no mínimo cinco sub-grupos funcionais depeptídeos membrano-ativos, sendo três desses grupos compostos por antimicrobianos, umde peptídeos penetradores de células e mais um de peptídeos membrano-ativos capazesunicamente de adsorção em membranas. Também as relações estrutura e função sãorevistas de acordo com esta nova perspectiva.O capítulo quatro descreve a determinação de parâmetros termodinâmicos para aadsorção do mesmo grupo de dezessete peptídeos em vesículas fosfolipídicas. Para tal, asisotermas de interação obtidas por calorimetria de titulação isotérmica (ITC) foramanalisadas pelo método de partição em superfície. Esse método é capaz de extrair dasisotermas uma constante de afinidade intrínsica ao peptídeo (Kp), a qual exclui efeitoseletrostáticos, além de uma constante de afinidade aparente (Kapp). Somente quatro dosdezessete peptídeos tiveram isotermas passíveis de ajuste com extração de parâmetrosverossímeis. Esses peptídeos tiveram interação primariamente eletrostáticas commembranas, conforme classificado no capítulo três. As causas do não ajuste das isotermasde interação para alguns peptídeos foram discutidas em detalhe e relacionadas ao seumecanismo de interação específico.
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Detalles del recurso
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Estratégias para prospecção e predição de peptídeos bioativos
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| Id. |
34357871 |
| Idioma |
PT
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| Titulo |
Estratégias para prospecção e predição de peptídeos bioativos |
| Autor(es) |
Guilherme Dotto Brand |
| Location |
http://bdtd.bce.unb.br/tedesimplificado/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=3082
|
| Versión |
1.0 |
| Estado |
Final
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| Descripción |
Os capítulos um e dois tratam da prospecção de peptídeos bioativos da secreçãode Phyllomedusa hypochondrialis. Mais especificamente, o primeiro aplica técnicasproteômicas, principalmente espectrometria de massa, para o estudo de peptídeosrelacionados à bradicinina (BRPs). Estes estavam presentes tanto na secreção solúvelquanto em fragmentos dissecados de pele do anfíbio. Dezoito BRPs, assim como suasmodificações pós-traducionais, foram caracterizados por seqüenciamento MS/MS denovoe experimentos de geração de imagens por MALDI em um fragmento de pele. Essasmoléculas tiveram alta similaridade de seqüência com as cininas plasmáticas de algunsmamíferos e répteis. Tamanha diversidade de moléculas dentro da mesma famíliapeptídica e pertencendo a mesma espécie pode estar relacionada à especializaçõesfuncionais desses peptídeos a uma variedade de receptores correspondentes em diferentespredadores. Também um novo análogo, [Val]1,[Thr]6-bradicinil-Gln,Ser teve suaatividade biológica detectada em culturas celulares expressando o receptor de bradicininahumana B2 e em preparações de íleo de porquinho-da-índia.O capítulo dois descreve a mesma aproximação metodológica para o estudo depeptídeos antimicrobianos da família das dermaseptinas. As estruturas primárias dessasmoléculas, nomeadas de DShypo 01, 02, 03, 04, 06 e 07 foram obtidas por experimentosMS/MS de novo, degradação de Edman e seqüenciamento de cDNA. O quinto peptídeofoi o mesmo DS 01 de Phyllomedusa oreades, previamente descrito pelo nosso grupo. Amaioria dos peptídeos purificados do extrato cutâneo total de P. hypochondrialis pôde serdiretamente localizada e mapeada em um fragmento de pele dorsal usando técnicas deobtenção de imagens por espectrometria de massa. Comparações foram feitas entrepeptídeos e drogas comerciais com relação à suas atividades antimicrobianas e contraLeishmania amazonensis. Também foram executados estudos comparativos dos efeitoslíticos em células do sangue de mamíferos e da interação com vesículas de DMPC porressonância plasmônica de superfície.Os capítulos três e quatro tratam do estudo da interação de peptídeos membranoativoscom membranas modelo, com ênfase em sua categorização em grupos e prediçãode atividade. Para tal, dezessete peptídeos membrano-ativos foram sintetizados e tiveram suas interações com vesículas unilamelares de DMPC e de DMPC/DMPG (2:1 mol/mol)estudadas por uma série de técnicas biofísicas. Estas técnicas permitiram a dissecção dasinterações entre peptídeos e membranas em termos de sua interação inicial, grau deinserção em membranas e indução de extravasamento de marcadores fluorescentes. Poresta aproximação, ficou clara a existência de no mínimo cinco sub-grupos funcionais depeptídeos membrano-ativos, sendo três desses grupos compostos por antimicrobianos, umde peptídeos penetradores de células e mais um de peptídeos membrano-ativos capazesunicamente de adsorção em membranas. Também as relações estrutura e função sãorevistas de acordo com esta nova perspectiva.O capítulo quatro descreve a determinação de parâmetros termodinâmicos para aadsorção do mesmo grupo de dezessete peptídeos em vesículas fosfolipídicas. Para tal, asisotermas de interação obtidas por calorimetria de titulação isotérmica (ITC) foramanalisadas pelo método de partição em superfície. Esse método é capaz de extrair dasisotermas uma constante de afinidade intrínsica ao peptídeo (Kp), a qual exclui efeitoseletrostáticos, além de uma constante de afinidade aparente (Kapp). Somente quatro dosdezessete peptídeos tiveram isotermas passíveis de ajuste com extração de parâmetrosverossímeis. Esses peptídeos tiveram interação primariamente eletrostáticas commembranas, conforme classificado no capítulo três. As causas do não ajuste das isotermasde interação para alguns peptídeos foram discutidas em detalhe e relacionadas ao seumecanismo de interação específico. |
| Tipo |
PDF |
| Palabras clave |
peptídeo antimicrobiano |
| Tipo de recurso |
Electronic Thesis or Dissertation
Tese ou Dissertacao Eletronica
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| Tipo de Interactividad |
Expositivo
|
| Nivel de Interactividad |
muy bajo
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| Audiencia |
Estudiante
Profesor
Autor
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| Estructura |
Atomic |
| Coste |
no
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| Copyright |
sí
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| Fecha de contribución |
06-sep-2008 |
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