Este trabalho foi realizado no rio Santo Aleixo, município de Magé do estado doRio de Janeiro, com coletas semanais de larvas de simulídeos no período de dois períodosnão consecutivos (2001 ? 2002 e 2003 ? 2004), objetivando avaliar a influência datemperatura da água do criadouro natural de larvas de Simulium (Chirostilbia) pertinax(Diptera: Simuliidae), na prevalência de infecção por Amblyospora sp. (Microsporidia:Amblyosporidae) e Polydispyrenia sp. (Microsporidia: Duboscqiidae), na população naturaldestas larvas.Os resultados obtidos demonstram que as infecções nas larvas de S.pertinax porAmblyospora sp. tem maior prevalência, quando comparadas com as infecções porPolydispyrenia sp., e com isso verificou-se que as infecções não seguem o mesmo padrão,apresentando enzootias diferentes, onde o gênero Amblyospora apresentou ocorrência emquase todos os meses em que foi realizado o estudo, com exceção apenas do mês dedezembro de 2001, promovendo alguns picos epizoóticos neste período. Então, ascondições disponíveis para a colonização de larvas de S. pertinax neste criadouro permitemobservar que existe um maior favorecimento ao parasitismo pelo gênero Amblyospora.Segundo a tabela de Rugg, os dados observados entre a influência da temperatura daágua do criadouro natural e as infecções por Amblyospora sp., evidenciam que no primeiroano de estudo houve uma forte correlação negativa e significativa (r = -0,65), enquanto queno segundo ano esta correlação negativa foi considerada significativa e apreciável (r = -0,43). Ao contrário deste, Polydispyrenia sp. apresentou correlação desprezível (r = -0,10)no primeiro período e (r = 0,10) no segundo período, ou seja, não significativa em ambos osperíodos de desenvolvimento do trabalho. Porém, quando o tamanho da amostra foiexpurgado, observou-se que a correlação foi significativa somente entre a temperatura daágua e o gênero Amblyospora no primeiro período estudado (r = -0,64). Esta constatação éimportante pelo fato de não existirem relatos na literatura deste tipo de estudo empopulação de Simulium pertinax.Infecções por Amblyospora sp. e Polydispyrenia sp. tem sido relatadas em diversasespécies de simulídeos na América do Sul, porém pouco se sabe sobre seus aspectosepizoóticos e enzoóticos, e os fatores-chave que atuam e regulam as microsporidioses nas populações hospedeiras nestes sistemas.