Cette étude compare l'efficacité et le mode d'utilisation de deux outils informatiques destinés à l'apprentissage de notions de base en virologie. Le premier outil, VIROLAB, est un laboratoire de biologie simulé dans lequel l'apprenant doit aider des virus défectueux à se multiplier. La connaissance du domaine est introduite formellement dans un hypertexte intégré. L'apprentissage se fait par résolution de problèmes et, éventuellement, par la lecture de l'hypertexte. Le deuxième outil est l'hypertexte qui se trouve dans VIROLAB mais considéré, cette fois-ci, comme un environnement d'apprentissage indépendant. Afin de guider sa lecture, cet hypertexte contient une série de questions à choix multiples et ouvertes. L'apprentissage se fait par la lecture. Dans ce travail nous nous sommes penchés sur deux questions : 1) lequel des deux outils est le plus efficace en terme d'acquisition de connaissances et 2) comment les hypertextes sont-ils utilisés. La comparaison des scores aux pré- et post-tests a montré qu'aucun des deux outils d'apprentissage ne semble supérieur àl'autre. Par contre VIROLAB semble favoriser l'acquisition d'un type particulier de connaissances. À notre grand étonnement, l'analyse des traces de navigation a montré que les utilisateurs de VIROLAB lisent l'hypertexte en dehors du processus de résolution de problèmes.