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Archivo Digital UPM (107.543 recursos)

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Materia = Genética

Mostrando recursos 1 - 20 de 33

  1. Dynamical community structure of populations evolving on genotype networks

    Capitán Gómez, José Ángel; Aguirre, Jacobo; Manrubia, Susanna
    Neutral evolutionary dynamics of replicators occurs on large and heterogeneous networks of genotypes. These networks, formed by all genotypes that yield the same phenotype, have a complex architecture that conditions the molecular composition of populations and their movements on genome spaces. Here we consider as an example the case of populations evolving on RNA secondary structure neutral networks and study the community structure of the network revealed through dynamical properties of the population at equilibrium and during adaptive transients. We unveil a rich hierarchical community structure that, eventually, can be traced back to the non-trivial relationship between RNA secondary structure...

  2. La prueba de ADN en el proceso penal: análisis de sensibilidad de los cálculos probabilistas

    Castro del Barrio, Ricardo
    El ADN, ácido desoxirribonucleico, es un compuesto orgánico que contiene las instrucciones genéticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos los organismos vivos conocidos y algunos virus. Las secuencias de ADN que constituyen la unidad fundamental, física y funcional de la herencia se denominan genes. Excepto para gemelos monocigóticos o univitelinos, el ADN de una persona es único. Esto se debe a que un cromosoma de cada par se hereda del padre y el otro de la madre. Cada cromosoma de un par dado es independiente del otro. La combinación de cromosomas que presenta un individuo es conocida como genotipo. De...

  3. Libro de Actas del VII Congreso de estudiantes de Ciencia, Tecnología e Ingeniería Agronómica

    García Rebollar, Pilar; Mauleón Pérez, Iñigo; Rodríguez Francisco, María
    En este VII Congreso de estudiantes volvemos agradecer a todos los profesores y alumnos su participación y colaboración en todo momento para que en este Libro de Actas que tienes entre tus manos se hayan recopilado los trabajos de más de 100 estudiantes. Todos los trabajos han sido revisados por los profesores del Comité Científico del Congreso y esperamos que las correcciones hayan sido de utilidad a los autores. Ya sólo queda “la puesta en escena” con la exposición y los nervios de hablar en público. Se dice que “no hay temas aburridos, sino oradores poco entusiastas”. Sabemos que nuestros...

  4. Papel de la interleuquina 23 en la diferenciación hacia Th17

    Yagüe Sanz, Patricia
    The incidence of inflammatory and autoimmune diseases has increased among developed countries in the past 30 years, creating a demand for the development of effective and economic therapies for these diseases. Interleukin 23 (IL-23) is a pro-inflammatory cytokine whose increased production has been shown to play a key role in the establishment and maintenance of inflammatory and autoimmune diseases in different murine models such as inflammatory bowel disease, psoriasis and experimental autoimmune encephalomyelitis. More importantly, increased levels of IL-23 have been found in biopsies from patients with Crohn’s disease and ulcerative colitis, and psoriasis. The pathological consequences of excessive IL-23...

  5. Structuring research methods and data with the research object model: genomics workflows as a case study

    Hettne, Kristina M.; Dharuri, Harish; Jun, Zhao; Wolstencroft, Katherine; Belhajjame, Khalid; Soiland-Reyes, Stian; Mina, Eleni; Thompson, Mark; Cruickshank, Don; Verdes-Montenegro, Lourdes; Garrido, Julián; Roure, David de; Corcho, Oscar; Klyne, Graham; Schouwen, Reinout van; Hoen, t'Peter-Bram; Bechhofer, Sean; Goble, Carole; Roos, Marco
    Background: One of the main challenges for biomedical research lies in the computer-assisted integrative study of large and increasingly complex combinations of data in order to understand molecular mechanisms. The preservation of the materials and methods of such computational experiments with clear annotations is essential for understanding an experiment, and this is increasingly recognized in the bioinformatics community. Our assumption is that offering means of digital, structured aggregation and annotation of the objects of an experiment will provide necessary meta-data for a scientist to understand and recreate the results of an experiment. To support this we explored a model for the semantic description of a workflow-centric...

  6. Expresión de la resistencia en plantas de tomate a nematodos formadores de nódulos (Meloidogyne javanica)

    Emiliozzi Kauffmann, Mariana
    La resistencia genética mediada por los genes R es uno de los sistemas de defensa de las plantas frente a patógenos y se activa una vez que los patógenos han superado la defensa basal que otorgan la cutícula y pared celular. Los mecanismos de resistencia genética se inician a su vez, por el reconocimiento de productos derivados de genes de avirulencia de los patógenos (avr) por parte de las proteínas R. Tanto la respuesta de defensa basal como la respuesta de defensa por genes R están influenciadas por patrones de regulación hormonal, que incluye a las principales hormonas vegetales ácido...

  7. Cycling Dof Factors: Molecular and functional characterization of Arabidopsis thaliana AtCDF3 and tomato (Solanum lycopersicum L.) SlCDF3 in response to abiotic stress

    Corrales Ducuara, Alba Rocío
    El tomate (Solanum lycopersicum L.) es considerado uno de los cultivos hortícolas de mayor importancia económica en el territorio Español. Sin embargo, su producción está seriamente afectada por condiciones ambientales adversas como, salinidad, sequía y temperaturas extremas. Para resolver los problemas que se presentan en condiciones de estrés, se han empleado una serie de técnicas culturales que disminuyen sus efectos negativos, siendo de gran interés el desarrollo de variedades tolerantes. En este sentido la obtención y análisis de plantas transgénicas, ha supuesto un avance tecnológico, que ha facilitado el estudio y la evaluación de genes seleccionados en relación con la...

  8. Inference Models in DNA Computing

    Sainz de Murieta Fuentes, Iñaki
    La computación molecular es una disciplina que se ocupa del diseño e implementación de dispositivos para el procesamiento de información sobre un sustrato biológico, como el ácido desoxirribonucleico (ADN), el ácido ribonucleico (ARN) o las proteínas. Desde que Watson y Crick descubrieron en los años cincuenta la estructura molecular del ADN en forma de doble hélice, se desencadenaron otros descubrimientos, como las enzimas de restricción o la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), contribuyendo de manera determinante a la irrupción de la tecnología del ADN recombinante. Gracias a esta tecnología y al descenso vertiginoso de los precios de secuenciación...

  9. Human midbrain precursors activate the expected developmental genetic program and differentiate long-term to functional A9 dopamine neurons in vitro. Enhancement by Bcl-XL

    Gonzalez Seiz, Emma; Ramos Gomez, Milagros; Courtois, Elise T.; Tonnesen, Jan; Kokaia, Merab; Liste, Isabel; Martinez Serrano, Alberto
    Understanding the molecular programs of the generation of human dopaminergic neurons (DAn) from their ventral mesencephalic (VM) precursors is of key importance for basic studies, progress in cell therapy, drug screening and pharmacology in the context of Parkinson's disease. The nature of human DAn precursors in vitro is poorly understood, their properties unstable, and their availability highly limited. Here we present positive evidence that human VM precursors retaining their genuine properties and long-term capacity to generate A9 type Substantia nigra human DAn (hVM1 model cell line) can be propagated in culture. During a one month differentiation, these cells activate all...

  10. Integration of socioeconomic and genetic aspects involved in the conservation of animal genetic resources = Integración de aspectos socioeconómicos y genéticos involucrados en la conservación de recursos genéticos animales

    Martín Collado, Daniel
    El sector ganadero está siendo gradualmente dominado por sistemas intensivos y especializados en los que los factores de producción están controlados y en los que los caracteres productivos son los criterios principales para la selección de especies y razas. Entretanto, muchos de los bienes y servicios que tradicionalmente suministraba el ganado, tales como los fertilizantes, la tracción animal o materias primas para la elaboración vestimenta y calzado están siendo reemplazados por productos industriales. Como consecuencia de ambos cambios, las razas seleccionadas intensivamente, las cuales están estrechamente ligadas a sistemas agrícolas de alta producción y altos insumos, han desplazado a muchas...

  11. Computational methods to create and analyze a digital gene expression atlas of embryo development from microscopy images

    Castro González, Carlos
    Abstract The creation of atlases, or digital models where information from different subjects can be combined, is a field of increasing interest in biomedical imaging. When a single image does not contain enough information to appropriately describe the organism under study, it is then necessary to acquire images of several individuals, each of them containing complementary data with respect to the rest of the components in the cohort. This approach allows creating digital prototypes, ranging from anatomical atlases of human patients and organs, obtained for instance from Magnetic Resonance Imaging, to gene expression cartographies of embryo development, typically achieved from...

  12. Caracterización molecular del mutante riso 1508 de cebada : modificaciones transcripcionales y posttranscripcionales en el desarrollo de la semilla

    Hernando Amado, Sara
    La semilla es el principal órgano reproductivo de las plantas espermatofitas, permitiendo la dispersión de las poblaciones y asegurando su supervivencia gracias a su tolerancia a la desecación y a su capacidad para germinar bajo condiciones ambientales óptimas. El rendimiento y valor económico de los cereales, que constituyen la primera cosecha mundial, depende, en buena medida, de la eficacia con que se acumulan en la semilla sustancias de reserva: proteínas, carbohidratos y lípidos. El principal carbohidrato acumulado en la semilla de cebada es el almidón y la fracción mayoritaria de proteínas es la de las prolaminas (solubles en etanol al...

  13. Genes implicados en la respuesta molecular al estrés hídrico en Pinus pinaster Ait

    Perdiguero Jimenez, Pedro
    La presente tesis doctoral se centra en el estudio de la respuesta molecular de las coníferas mediterráneas al estrés hídrico. Para ello se ha escogido como especie modelo Pinus pinaster Ait., la conífera más abundante en España, y que habita un amplio rango de situaciones ecológicas, especialmente en lo relativo a la disponibilidad de agua. En primer lugar, se ha aplicado un estrés hídrico controlado en cultivo hidropónico y se ha generando una genoteca sustractiva con objeto de identificar los genes inducidos por el estrés, analizando su expresión en raíces, tallos y acículas. A continuación, se ha analizado, la expresión...

  14. Oscillatory genetic circuits: new designs and mathematical models

    Miró Bueno, Jesús María
    Introduction and motivation: A wide variety of organisms have developed in-ternal biomolecular clocks in order to adapt to cyclic changes of the environment. Clock operation involves genetic networks. These genetic networks have to be mod¬eled in order to understand the underlying mechanism of oscillations and to design new synthetic cellular clocks. This doctoral thesis has resulted in two contributions to the fields of genetic clocks and systems and synthetic biology, generally. The first contribution is a new genetic circuit model that exhibits an oscillatory behav¬ior through catalytic RNA molecules. The second and major contribution is a new genetic circuit model...

  15. A common mechanism of defective channel trafficking underlying DFNA2 hearing loss result in different cell surface expression levels of KCNQ4 mutants

    Morin, M.; Mayo, F.; Gonzalez Nieto, Daniel; Fasciani, I.; Castillo, I. del; Moreno, F.; Barrio, L.; Moreno Pelayo, M.A.
    KCNQ4 mutations underlie DFNA2, a subtype of autosomal dominant hearing loss. We had previously identified the pore-region p.G296S mutation that impaired channel activity in two manners: it greatly reduced surface expression and abolished channel function. Moreover, G296S mutant exerted a strong dominant-negative effect on potassium currents by reducing the channel expression at the cell surface representing the first study to identify a trafficking-dependent dominant mechanism for the loss of KCNQ4 channel function in DFNA2. Here, we have investigated the pathogenic mechanism associated with all the described KCNQ4 mutations (F182L, W242X, E260K, D262V, L274H, W276S, L281S, G285C, G285S and G321S) that...

  16. Influencia de varios polimorfismos en los genes MCT1 y CPT2 sobre el metabolismo energético durante el ejercicio

    Cupeiro Coto, Rocío
    Las diferencias individuales ante cualquier estímulo son parte de la condición humana, y reflejan nuestra diversidad genética, así como la influencia del entorno. Conocer el papel que juegan las variaciones genéticas o polimorfismos, es vital para entender de forma integral la respuesta del organismo al ejercicio. Por tanto, el presente trabajo tiene como objetivo fundamental definir el posible rol de tres variantes genéticas en el metabolismo energético durante la realización de ejercicio físico. Más concretamente, los objetivos principales son, por un lado, observar si existen diferencias en la respuesta láctica en sangre capilar y venosa en función del polimorfismo A1470T del...

  17. Competition may explain the fine-scale spatial patterns and genetic structure of two co-occurring plant congeners

    Matesanz, Silvia; Gimeno, Teresa E.; Cruz Rot, Marcelino de la; Escudero, Adrián; Valladares Ros, Fernando
    1. The spatial distribution of individual plants within a population and the population’s genetic structure are determined by several factors, like dispersal, reproduction mode or biotic interactions. The role of interspecific interactions in shaping the spatial genetic structure of plant populations remains largely unknown. 2. Species with a common evolutionary history are known to interact more closely with each other than unrelated species due to the greater number of traits they share. We hypothesize that plant interactions may shape the fine genetic structure of closely related congeners. 3. We used spatial statistics (georeferenced design) and molecular techniques (ISSR markers) to understand how two closely related...

  18. Scaling laws in bacterial genomes: A side-effect of selection of mutational robustness?

    Beslon, Guillaume; Parsons, David; Sanchez Dehesa, Yolanda; Peña Sanchez, Jose Maria; Knibbeb, Carole
    In the past few years, numerous research projects have focused on identifying and understanding scaling properties in the gene content of prokaryote genomes and the intricacy of their regulation networks. Yet, and despite the increasing amount of data available, the origins of these scalings remain an open question. The RAevol model, a digital genetics model, provides us with an insight into the mechanisms involved in an evolutionary process. The results we present here show that (i) our model reproduces qualitatively these scaling laws and that (ii) these laws are not due to differences in lifestyles but to differences in the...

  19. Actas del IV Congreso de estudiantes de Ciencia, Tecnología e Ingeniería Agronómica

    García Rebollar, Pilar; Gili Pozo, Álvaro; Pérez Cabal, M.A.
    Se trata de los trabajos presentados por los alumnos en el IV Congreso de estudiantes de Ciencia, Tecnología e Ingeniería Agronómica

  20. Sistema de Identificacion, Extracción y Recuperación de Secuencias Genéticas a partir de la Literatura Científica

    Cuevas Candela, Alejandro
    Las tecnologías moleculares se usan con frecuencia en la práctica clínica para la identificación de microorganismos y detección de la presencia de factores virulentos, resistencia a antibióticos e interacciones huésped-paciente (Bravo et al., 2009). Por ejemplo, se han desarrollado numerosos ensayos sobre ácidos nucleicos (Mothershed et al., 2006) utilizando hibridación o técnicas de extensión de ADN que incluyen un amplio rango de tecnologías como métodos de PCR (Ratcliff et al., 2007), secuenciación de genes y genomas completos (Woo et al., 2008; Enright et al., 1999), Luminex (Pabbaraju et al., 2008) y análisis de mircoarrays (Miller et al., 2009) Existen un...

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